色譜柱的安裝會影響氣相分析的重復性。具體來說，毛細柱的安裝長度是有嚴格要求的，如果毛細柱安裝長度的改變，將影響氣相色譜分析的重復性。另外，毛細柱安裝位置不正確，會導致靈敏度嚴重下降，甚至于待檢物質不出峰。

因此，在安裝毛細柱時，應確保毛細柱的柱頭能夠伸入到襯管的合適位置，并控制好毛細柱的安裝長度。同時，如果樣品中有兩個組分同時從色譜柱里跑出來，重疊的峰會影響分析結果，這時可以通過調整前處理方法、改變色譜條件等方法來使重疊的峰分開。